<div dir="ltr">Hello Lex,<div><br></div><div>thank you very much for helping. When I type R from normal bash outside geany it works fine. When I type geany -v at the prompt outside geany, this is what I get</div><div><br></div>
<div><div>marco@marco-desktop:~$ geany -v</div><div>Geany-INFO: Geany 1.23, en_GB.UTF-8</div><div>Geany-INFO: GTK 2.24.10, GLib 2.32.3</div><div>Geany-INFO: System data dir: /usr/share/geany</div><div>Geany-INFO: User config dir: /home/marco/.config/geany</div>
<div>Geany-INFO: System plugin path: /usr/lib/x86_64-linux-gnu/geany</div><div>Geany-INFO: Added filetype Go (55).</div><div>Geany-INFO: Added filetype Cython (56).</div><div>Geany-INFO: Added filetype Genie (57).</div><div>
Geany-INFO: Added filetype Scala (58).</div><div>Geany-INFO: /home/marco/R/tex/commentary.tex : LaTeX (UTF-8)</div><div>Geany-INFO: /home/marco/R/reportEurope1.r : R (UTF-8)</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div>
<div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div>
<br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br>
</div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div>
<div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>
(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div>
<div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div>
<br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br>
</div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div>
<div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>
(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div>
<div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div>
<br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div><br></div><div>(geany:2732): Tagmanager-CRITICAL **: get_tag_type: assertion `tag_name' failed</div><div>Geany-INFO: Missing symbol-tree parent iter for type 524288!</div>
<div>Geany-INFO: Missing symbol-tree parent iter for type 524288!</div><div>Geany-INFO: Missing symbol-tree parent iter for type 524288!</div><div>Geany-INFO: Missing symbol-tree parent iter for type 524288!</div><div>Geany-INFO: Missing symbol-tree parent iter for type 524288!</div>
<div>Geany-INFO: Missing symbol-tree parent iter for type 524288!</div><div>Geany-INFO: Missing symbol-tree parent iter for type 524288!</div><div>Geany-INFO: Missing symbol-tree parent iter for type 524288!</div><div>Geany-INFO: Missing symbol-tree parent iter for type 524288!</div>
<div>Geany-INFO: Missing symbol-tree parent iter for type 524288!</div><div><br></div><div>(geany:2732): LIBDBUSMENU-GTK-CRITICAL **: watch_submenu: assertion `GTK_IS_MENU_SHELL(menu)' failed</div><div><br></div><div>
It looks therefore there is an error in GTK MENU SHELL...</div><div><br></div><div>Marco</div><div><br></div></div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Sun, Jul 28, 2013 at 6:41 AM, Lex Trotman <span dir="ltr"><<a href="mailto:elextr@gmail.com" target="_blank">elextr@gmail.com</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><br><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote"><div class="im">On 28 July 2013 07:32, Matthew Brush <span dir="ltr"><<a href="mailto:mbrush@codebrainz.ca" target="_blank">mbrush@codebrainz.ca</a>></span> wrote:<br>

<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div>On 13-07-27 01:24 PM, Marco Bianchi wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
I don't understand because when I run a .sh file invoking R code from the<br>
command line it works without any problem at all? Also if I type which R at<br>
prompt I get /usr/bin/R which is correct directory etc...<br></blockquote></div></blockquote><div><br></div></div><div>Do you get the > prompt if you actually run R at the command line (instead of "which R")?</div>

<div><br></div><div>If so then you should also get it in Geany.  The fact that you don't says something is wrong with that part of the setup.  Run geany from the command line with -v option and post the results.</div>

<div><br></div><div>If you don't get the > prompt running R from the command line then the problem is in your R setup</div><div><br></div><div>Cheers</div><span class="HOEnZb"><font color="#888888"><div>Lex</div></font></span><div>
<div class="h5"><div><br></div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br>
</blockquote>
<br></div>
For what it's worth, I just installed r-base on Ubuntu 13.04 and set the shell setting to /usr/bin/R and it works as expected, the R interpreter shell is run and I can send text to it using <Ctrl>+4 after setting it up to send text to terminal. I'm using fairly recent Geany compiled from Git master branch.<br>


<br>
Not sure what the problem could be, other than maybe if you didn't restart Geany to get the new shell running (or even maybe typing "exit" without restarting Geany). Maybe try to use `/usr/bin/R --interactive` for the Shell?<br>


<br>
Cheers,<br>
Matthew Brush<div><div><br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br>
On Sat, Jul 27, 2013 at 2:29 PM, Lex Trotman <<a href="mailto:elextr@gmail.com" target="_blank">elextr@gmail.com</a>> wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br>
<br>
<br>
On 27 July 2013 22:29, Marco Bianchi <<a href="mailto:marcolondonuk@gmail.com" target="_blank">marcolondonuk@gmail.com</a>> wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Dear Users,<br>
<br>
I love geany lightweight editor which I have used for a couple of years<br>
now. I have made a brand new installation of Ubuntu 12.04 64bit on a brand<br>
new hard disk etc and then I have installed geany, version below:<br>
<br>
geany 1.23 (built on Apr  7 2013 with GTK 2.24.10, GLib 2.32.3)<br>
<br>
I have installed libvte9 too. My issue with geany is that it does not<br>
send commands to terminal.<br>
Any idea why this is happening?<br>
<br>
marco<br>
<br>
PS: It can be seen from the image below that I have selected the first<br>
three lines of code, but nothing happens when I send those lines to<br>
terminal using the CTRL-4 key (which I have defined in keybindings). I also<br>
attach more images showing set up of some of my preferences tabs.<br>
<br>
<br>
</blockquote>
As there is no prompt in the terminal it would appear that your shell, R,<br>
is not running properly.<br>
<br>
Cheers<br>
Lex<br>
<br>
______________________________<u></u>_________________<br>
Users mailing list<br>
<a href="mailto:Users@lists.geany.org" target="_blank">Users@lists.geany.org</a><br>
<a href="https://lists.geany.org/cgi-bin/mailman/listinfo/users" target="_blank">https://lists.geany.org/cgi-<u></u>bin/mailman/listinfo/users</a><br>
<br>
<br>
</blockquote>
<br>
<br>
<br>
______________________________<u></u>_________________<br>
Users mailing list<br>
<a href="mailto:Users@lists.geany.org" target="_blank">Users@lists.geany.org</a><br>
<a href="https://lists.geany.org/cgi-bin/mailman/listinfo/users" target="_blank">https://lists.geany.org/cgi-<u></u>bin/mailman/listinfo/users</a><br>
<br>
</blockquote>
<br>
______________________________<u></u>_________________<br>
Users mailing list<br>
<a href="mailto:Users@lists.geany.org" target="_blank">Users@lists.geany.org</a><br>
<a href="https://lists.geany.org/cgi-bin/mailman/listinfo/users" target="_blank">https://lists.geany.org/cgi-<u></u>bin/mailman/listinfo/users</a><br>
</div></div></blockquote></div></div></div><br></div></div>
<br>_______________________________________________<br>
Users mailing list<br>
<a href="mailto:Users@lists.geany.org">Users@lists.geany.org</a><br>
<a href="https://lists.geany.org/cgi-bin/mailman/listinfo/users" target="_blank">https://lists.geany.org/cgi-bin/mailman/listinfo/users</a><br>
<br></blockquote></div><br></div>